Ya encontré la solución. Aquí la dejo por si a alguien le puede ser de utilidad. Me he ido a "herramientas" - "filtros de mensajes" para ver si había algo raro (ya que tengo muchos filtros activos) y sí que lo había... Me encontré uno cuyo nombre era: "Hacer coincidir todos los mensajes". Estaba marcada la casilla "Al recuperar el correo nuevo" y la selección "filtrar antes de identificar el correo basura" Y la acción elegida en el último campo era la de "eliminar" Así que evidentemente eliminaba todo correo entrante. No hay más que seleccionar solo ese filtro y eliminarlo.